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Am Vorabend der schlimmsten Katastrophe der Menschheitsgeschichte legt sich die Kongressabgeordnete Jennifer Brown mit dem Präsidenten an. Ihre Kinder Yorick und Hero stehen an emotionalen Scheidepunkten. Niemand von ihnen weiß, dass sich ihre Leben für immer verändern werden.

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Yorick und Jennifer sind wieder vereint und Agent 355 plant, was nun passiert.Die Tochter des verstorbenen Präsidenten, Kimberly, kreist Jennifers Geheimnis ein. Nora Brady und ihre Tochter Mack verlassen ihr Zuhause.

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Auf Jennifers Befehl suchen Yorick und Agent 355 nach einer Genetikerin, die herausfinden soll, wieso Yorick überleben konnte. Hero und Sam treffen inzwischen auf eine gefährliche Gruppe von Frauen.

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Yorick und Agent 355 suchen im kriegsgeschunden Boston nach Dr. Allison Mann. In D.C. verbirgt Jennifer die Wahrheit über Yorick vor ihren politischen Rivalen.

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Yorick, Agent 355 und Dr. Mann stoßen auf ihrem Weg nach San Francisco auf ein Hindernis. Während sich die Suche nach 355 zuspitzt, gerät Jennifer mit der ehemaligen Kabinettssekretärin Regina Oliver aneinander, die ein Auge auf die Präsidentschaft geworfen hat. Hero wird von der charismatischen Anführerin Roxanne verführt, während Sam und Nora sich mit ihrem Platz in einer gefährlichen Gruppe von Überlebenden auseinandersetzen müssen.